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植物利用“加密通话”?Z6·尊龙凯时科学家破解RNA密码,操控蛋白质合成!

发布时间:2025-03-21   信息来源:秦曼琪

导读:你是否曾想过,植物的生物机制中存在一套神秘的“分子指令”?最近,科学家们揭示了植物RNA中的假尿嘧啶(Ψ)信号,发现它宛如“指挥官”,通过三个层次的信号系统(rRNA、tRNA、mRNA)精确操控蛋白质合成。这一发现开启了微观世界的诸多奥秘,今天我们就来为你揭秘这场生物医疗领域的“细胞大战”!

植物利用“加密通话”?Z6·尊龙凯时科学家破解RNA密码,操控蛋白质合成!

假尿嘧啶(Ψ)是RNA中最常见的化学修饰,广泛存在于rRNA、tRNA、snRNA和mRNA中,并具有多种已知功能,包括稳定RNA的二级结构、调控RNA-蛋白质相互作用、以及影响翻译的效率与准确性。当前亟待解答的问题是:植物体内Ψ的全基因组分布特点,以及其在rRNA、tRNA和mRNA之间的协同作用机制。同时,Ψ修饰如何通过多层级的调控(例如核糖体功能、tRNA解码、mRNA翻译)来影响植物中的蛋白质合成。

文章索引

标题:Quantitative RNA pseudouridine maps reveal multilayered translation control through plant rRNA, tRNA and mRNA pseudouridylation

发表期刊:Nat Plants 发表时间:2025年2月 作者团队:美国霍华德休斯医学研究所 何川教授团队 IF:158 DOI:10.1038/s41477-024-01894-7

核心发现

  • rRNA的假尿嘧啶化能够全局控制翻译,但不同rRNAΨ位点的作用不尽相同。
  • tRNA T臂环中的Ψ显示与其各自密码子的翻译效率存在强正相关关系。
  • Ψ水平与mRNA的稳定性呈负相关,而与拟南芥幼苗的翻译效率则呈正相关。

研究结果

(1) BID-seq揭示了rRNA中保守的假尿嘧啶化。研究通过BID-seq技术(高精度Ψ检测方法)系统展示了植物rRNA中Ψ修饰的进化保守性,并关联其与核糖体功能的保守性。结果表明,核糖体活性中心相关的rRNA(如Nu-18S)的Ψ修饰在不同物种中高度保守。

(2) rRNA和tRNA的Ψ化学计量调控翻译。研究分析了拟南芥中mRNA丰度与蛋白质水平之间的关系,并对不同植物器官的Ψ修饰进行了比对,发现高能量组织中的Ψ修饰显著增多,从而支持其旺盛的代谢需求。

(3) 植物mRNA Ψ位点的跨种间保护性研究。分析表明,在单子叶与双子叶植物的mRNA样本中,Ψ位点的保守性显著低,显示出植物mRNA的Ψ修饰存在缺乏进化保守性的问题。

(4) 基于BID-seq技术的高分辨率Ψ修饰谱绘制,揭示了水稻与拟南芥中Ψ修饰的组织特异性模式及其对发育调控的影响。

(5) Ψ与mRNA的稳定性及翻译效率关系探究。研究发现,高Ψ比的mRNA展现出较低的不稳定性,表明Ψ位点位置与植物翻译调控的复杂性密切相关。

研究结论

本研究基于单碱基分辨率生成了多种植物物种的Ψ图谱,将rRNA、tRNA与mRNA的Ψ修饰及其与翻译效率的关系进行了有效结合,揭示了Ψ修饰在翻译效率调控中的多层次影响。该研究为进一步探讨植物中Ψ的生物医学价值提供了重要资源,并强调了通过rRNA、tRNA和mRNA中假尿嘧啶化实现广泛翻译调控的重要性。

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