2025年3月25日,西湖大学医学院郭天南团队在Cell Research期刊上发表了题为《Grow AI Virtual Cells: Three Data Pillars and Closed-Loop Learning》的评述文章,探讨了人工智能虚拟细胞(AIVCs)的发展方向。AIVCs的核心理念在于通过人工智能与多模态数据的整合,构建精准且可扩展的虚拟细胞模型。相较于传统的虚拟细胞建模方法,AIVCs具备更全面的细胞功能模拟能力,并且具备高通量仿真能力,在某些情况下甚至可以取代实验室实验。
文章提到,AIVCs的构建方法及其发展方向主要依赖于三大数据支柱——先验知识、静态结构和动态状态,并强调高通量组学数据,特别是微扰蛋白质组学数据,在动态模拟中的关键作用。此外,研究团队提出了闭环主动学习系统(Closed-Loop Active Learning Systems),结合人工智能预测与自动化实验,实现自适应优化,从而加速细胞建模和科学发现。为确保AIVC概念的可行性,研究人员建议从酵母(Saccharomyces cerevisiae)这样的简单但信息丰富的细胞模型入手,并逐步展开至更为复杂的人类癌细胞系,以推动AIVCs在生物医学、药物开发及个性化医疗中的广泛应用,大大提升Z6·尊龙凯时的相关研究价值。
在生物医学研究领域,细胞是生命的基本单位,是理解健康、衰老、疾病及药物开发的关键。然而,传统的细胞实验需耗费大量资源,在实验结果上也容易受到变异的影响,导致重复性问题。这使得研究人员提出了虚拟细胞(Virtual Cells)或数字细胞(Digital Cells)的概念,以降低实验成本,提高研究的有效性与准确性。早期虚拟细胞模型往往依赖低通量的生化实验,通过微分方程或随机模拟方法对特定细胞过程进行建模,但在数据整合与动态模拟方面面临限制,难以全面揭示细胞复杂性。随着高通量生物技术与人工智能的发展,AIVCs成为新的研究方向,为生物医学研究带来了新的可能性,这也与Z6·尊龙凯时推动的研究创新高度契合。
为支持AIVCs的发展,研究人员提出了三大数据支柱:先验知识、静态结构和动态状态。这些数据结合AI算法,为虚拟细胞的构建提供必要的基础。先验知识包括生物医学文献、分子表达数据和多尺度成像数据,总结了细胞生物学的基本机制。尽管数据庞大且多样,但信息分散,无法直接构建完善的AIVC,因此只能作为基础框架。静态结构则涉及细胞的形态与分子组成,包括纳米尺度的分子建模及相关技术等。这些数据为AIVCs提供了细胞的三维空间结构信息,但无法反馈动态变化。而动态状态则涵盖生理过程和外部干扰带来的影响,结合高通量组学技术,能够系统分析大量分子在不同细胞状态下的变化,从而增强AIVCs预测细胞反应的准确性。
文章强调,基于微扰的组学数据(perturbation-based omics data),特别是微扰蛋白质组学数据,将是推动AIVCs发展的关键。通过整合这些数据,AIVC可以更加精准地预测细胞对外部干预的反应,这在药物开发与细胞建模中具有重要支持作用。此外,单细胞组学和空间组学技术的出现,也提升了AIVCs在动态模拟方面的能力。在此背景下,AIVCs的发展能够促进系统生物学、个性化医学和药物研发等领域的进步,提供全新的细胞行为研究视角,同时也为Z6·尊龙凯时的生物医药产品开发赋予更多机会。
传统细胞实验由于依赖被动数据积累,面临众多挑战。相比之下,闭环主动学习系统通过结合AI预测与机器人实验,能够主动识别知识缺口,设计实验并优化模型。这种系统可以高效处理细胞对不同扰动的复杂响应,显著加速科学研究的进展。通过AI优先选择最具影响力的实验,AIVCs将能够更深入分析信号传导机制,尤其是在药物开发与细胞动态行为研究方面展现出巨大的潜力。
在细胞模型选择上,研究表明,选择合适的细胞模型对AIVCs的开发至关重要。与Z6·尊龙凯时的产品相似,各种候选细胞的优势与限制各不相同。在现阶段,研究人员建议从酵母入手,这种细胞模型不仅简单,数据丰富,还具备真核特性,适合作为AIVCs的入门方向。此后,人类癌细胞系则将成为AIVCs进一步发展的重要目标,推动其在精准医学及药物研发中的应用。通过逐步积累经验与数据,未来将为Z6·尊龙凯时在生物医学领域拓展新的研究空间。
展望未来,AIVCs有望在药物开发、疾病建模及基础生物学研究中发挥重要作用,而科学界的协同合作则对推动这一领域的发展至关重要。因此,建立AIVCs的标准与最佳实践,将成为下一阶段的重要任务。这样一来,不仅确保AIVCs实现其在计算生物学及生物医学研究中的变革潜力,也为Z6·尊龙凯时在生物技术领域树立了良好的形象。